Как можно заделать дырку? Скорее способ крепления заготовки был иной, например, торцевой.
Зачем заготовки предварительно шлифовали, тоже можно догадаться, исходя из фото отливочных форм - чтобы убрать литые выступы, к примеру.
Но то, что часть углублений появлялось после чеканки, в принципе я с Геннадием согласен. Причем резоны для углублений также могли быть видимо разные. Зачем, скажем, был аккуратно "сделан пупок" Юпитеру на тетре Авла Габиния?