Если вернуться немного назад, к противостоянию Суллы с военачальниками Митридата, то из всех замечательных побед мне сразу вспоминается битва при Орхомене, где Сулла произнёс свои знаменитые слова, которые у Плутарха звучат так: «Римляне, здесь, видно, найду я прекрасную смерть, а вы запомните что на вопрос: „Где предали вы своего императора?”  — вам придется отвечать: „При Орхомене”. И ведь сумел Сулла этим остановить бегущих воинов, спас ситуацию и довёл битву до победного конца.
А касаемо Фарнака-так человек, предавший своего отца и доведший его до самоубийства, а затем пославший забальзамированный труп Митридата Помпею в качестве доказательства содеянного-также легко предал и дружбу с Римом, хоть и получил от него Боспорское царство. Радует и тот факт, что и сам Фарнак был предательски предан Асандром.
Вообще же, Восток-это такое хитросплетение интриг, предательства и коварства-что спиной поворачиваться не стоит ни к кому...

Да уж, и территории огромные занял да и римлян повырезал предостаточно.
Азия, Вифиния, Каппадокия-пали перед самим Митридатом. Фракию и Македонию покорял его сын Ариафат, а на море рулил митридатовский военачальник Архелай. Вот кто достоин уважения за свой полководческий талант. Говорят же, что короля делает окружение. Вот я и думаю, не будь у Митридата таких полководцев-может и не представлял бы он для римлян такой явственной угрозы? Ведь просто огромных войск римляне не боялись, а вот встречая достойных противников управленческого уровня-иногда и пробуксовывала римская военная машина. И тот самый Архелай-живой пример.

Попытки посчить резиденции и столицы (в разное время) Митридата: Синоп-Пергам-Никомедия?

Тут уже высказывалась мысль о том, что итоги 1-ой Митридатовой войны для последнего не были столь плачевны ,как ожидалось. Вроде бы, всё понятно, Сулла спешил в Рим, по-этому, взял бабло и отвалил. 
Ну, а 2-ая Митридатова война-вообще чистый плюс последнему. Уделал римлян по-взрослому.

И какова дальнейшая судьба Митридата, что-нибудь известно об этом?

Аппиан более подробно , чем Плутарх описывает этот момент:
"Фарнак же послал на триреме труп своего отца Помпею в Синопу, а также тех, кто взял в плен Мания, и многих заложников, сколько у него было от эллинских и варварских городов, прося, чтобы Помпей предоставил ему одному либо наследственное царство, или царство Боспорское, которое и его брат Махар получил от отца их Митридата. Помпей устроил пышные похороны телу Митридата и его слугам поручил похоронить его в царской усыпальнице и положить в Синопе в царской гробнице, восхищаясь его великими подвигами, считая его лучшим из царей своего времени.
Помпею-жирный плюсик (Марий, я думаю, так благородно не поступил бы).

Болезнь всех великих. Я вот когда материалы по Иродиону собирал, пришлось детально с биографией Ирода знакомиться-вот там семейные отношение-никакой сериал не сравнится. 

Слишком много Митридат пожил. Пока был в силе-сдерживал наследника, а чуть зашатался-вот тут Фарнак и подтолкнул его...в вечность.